Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Prg3Q9JL95 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prg3Q9JL95 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms