Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl39Q9JKF7 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms