Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scamp5Q9JKD3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms