Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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