Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Smco4Q9JIS3 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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