Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn2Q9ER65 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms