Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clstn1Q9EPL2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms