Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnft1Q9DCN7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnft1Q9DCN7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Rnft1Q9DCN7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rnft1Q9DCN7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rnft1Q9DCN7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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