Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Rnf6Q9DBU5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rnf6Q9DBU5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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