Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc97Q9DBT3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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