Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Smg9Q9DB90 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg9Q9DB90 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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