Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Med27Q9DB40 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms