Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem239Q9DA47 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms