Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chmp4bQ9D8B3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms