Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cldn22Q9D7U6 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cldn22Q9D7U6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cldn22Q9D7U6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cldn22Q9D7U6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Cldn22Q9D7U6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cldn22Q9D7U6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms