Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srp19Q9D7A6 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms