Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Borcs8Q9D6Y4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms