Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ttc9bQ9D6E4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ttc9bQ9D6E4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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