Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sdr42e1Q9D665 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sdr42e1Q9D665 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Sdr42e1Q9D665 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sdr42e1Q9D665 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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