Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc83Q9D4V3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms