Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gcc1Q9D4H2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms