Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Krt20Q9D312 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms