Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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