Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan11Q9D1D1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms