Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gins3Q9CY94 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms