Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gtpbp8Q9CY28 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms