Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnot11Q9CWN7 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms