Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pfdn1Q9CWM4 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pfdn1Q9CWM4 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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