Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fcf1Q9CTH6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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