Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rab5aQ9CQD1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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