Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CQC3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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