Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b1Q99NB9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sf3b1Q99NB9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b1Q99NB9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms