Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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PtprtQ99M80 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PtprtQ99M80 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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