Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gdpd3Q99LY2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms