Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Rcbtb2Q99LJ7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rcbtb2Q99LJ7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms