Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ubxn2aQ99KJ0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms