Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Tmed9Q99KF1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms