Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pacsin3Q99JB8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pacsin3Q99JB8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms