Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ddb2Q99J79 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ddb2Q99J79 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ddb2Q99J79 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ddb2Q99J79 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ddb2Q99J79 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ddb2Q99J79 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ddb2Q99J79 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ddb2Q99J79 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ddb2Q99J79 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ddb2Q99J79 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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