Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apobec3Q99J72 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apobec3Q99J72 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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