Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PdgfdQ925I7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PdgfdQ925I7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms