Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rnf144aQ925F3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Rnf144aQ925F3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rnf144aQ925F3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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