Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klc3Q91W40 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klc3Q91W40 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms