Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26594-201ENSMUST00000180383 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms