Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Fam20bQ8VCS3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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