Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApobrQ8VBT6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms