Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nup58Q8R332 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms