Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Rnf183Q8QZS5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Rnf183Q8QZS5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Rnf183Q8QZS5 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Rnf183Q8QZS5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Rnf183Q8QZS5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rnf183Q8QZS5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
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Rnf183Q8QZS5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Rnf183Q8QZS5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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Rnf183Q8QZS5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Rnf183Q8QZS5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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