Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MyripQ8K3I4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MyripQ8K3I4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms