Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Lrrtm1Q8K377 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Lrrtm1Q8K377 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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